Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM44Q96DX7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM44Q96DX7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms