Protein–RNA interactions for Protein: Q96AN5

TMEM143, Transmembrane protein 143, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM143Q96AN5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM143Q96AN5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM143Q96AN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM143Q96AN5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM143Q96AN5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms