Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF34Q969K3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF34Q969K3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RNF34Q969K3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF34Q969K3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms