Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRN2Q92932 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRN2Q92932 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRN2Q92932 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRN2Q92932 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms