Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAD50Q92878 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD50Q92878 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD50Q92878 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD50Q92878 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms