Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT35Q92764 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT35Q92764 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT35Q92764 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms