Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6NLQ92738 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6NLQ92738 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6NLQ92738 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP6NLQ92738 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP6NLQ92738 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.57■■■□□ 2
USP6NLQ92738 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP6NLQ92738 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6NLQ92738 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP6NLQ92738 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP6NLQ92738 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP6NLQ92738 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6NLQ92738 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6NLQ92738 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6NLQ92738 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP6NLQ92738 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP6NLQ92738 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6NLQ92738 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP6NLQ92738 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
USP6NLQ92738 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6NLQ92738 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6NLQ92738 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP6NLQ92738 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP6NLQ92738 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP6NLQ92738 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP6NLQ92738 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP6NLQ92738 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP6NLQ92738 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP6NLQ92738 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP6NLQ92738 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms