Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF516Q92618 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF516Q92618 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF516Q92618 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF516Q92618 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms