Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD6Q92537 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUSD6Q92537 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SUSD6Q92537 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SUSD6Q92537 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms