Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf40Q8WZ69 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C11orf40Q8WZ69 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf40Q8WZ69 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf40Q8WZ69 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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