Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLEC4DQ8WXI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLEC4DQ8WXI8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLEC4DQ8WXI8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLEC4DQ8WXI8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms