Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL1Q8WXF7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL1Q8WXF7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL1Q8WXF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATL1Q8WXF7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms