Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NSMCE1Q8WV22 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSMCE1Q8WV22 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMCE1Q8WV22 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMCE1Q8WV22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms