Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA2Q8TDQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA2Q8TDQ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms