Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PROKR1Q8TCW9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PROKR1Q8TCW9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROKR1Q8TCW9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms