Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM71BQ8TC56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM71BQ8TC56 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM71BQ8TC56 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms