Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MDM1Q8TC05 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MDM1Q8TC05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MDM1Q8TC05 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms