Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KNL1Q8NG31 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNL1Q8NG31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KNL1Q8NG31 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KNL1Q8NG31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms