Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU4

FDCSP, Follicular dendritic cell secreted peptide, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDCSPQ8NFU4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FDCSPQ8NFU4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDCSPQ8NFU4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FDCSPQ8NFU4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms