Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG4

FAM83F, Protein FAM83F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83FQ8NEG4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM83FQ8NEG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM83FQ8NEG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM83FQ8NEG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM83FQ8NEG4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM83FQ8NEG4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM83FQ8NEG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms