Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CATSPER1Q8NEC5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CATSPER1Q8NEC5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CATSPER1Q8NEC5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms