Protein–RNA interactions for Protein: Q8N819

PPM1N, Probable protein phosphatase 1N, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1NQ8N819 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPM1NQ8N819 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPM1NQ8N819 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPM1NQ8N819 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms