Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NANOGP1Q8N7R0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NANOGP1Q8N7R0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NANOGP1Q8N7R0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms