Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSGALNACT2Q8N6G5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSGALNACT2Q8N6G5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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