Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MINDY1Q8N5J2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MINDY1Q8N5J2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MINDY1Q8N5J2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms