Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHTF2Q8N3S3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF2Q8N3S3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF2Q8N3S3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms