Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPM1KQ8N3J5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPM1KQ8N3J5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPM1KQ8N3J5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPM1KQ8N3J5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms