Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS6

PALM2, Paralemmin-2, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2Q8IXS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALM2Q8IXS6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PALM2Q8IXS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PALM2Q8IXS6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2Q8IXS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PALM2Q8IXS6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms