Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NELFCDQ8IXH7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NELFCDQ8IXH7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NELFCDQ8IXH7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NELFCDQ8IXH7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms