Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRSK2Q8IWQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRSK2Q8IWQ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BRSK2Q8IWQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRSK2Q8IWQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms