Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVP5

FUNDC1, FUN14 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC1Q8IVP5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FUNDC1Q8IVP5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FUNDC1Q8IVP5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FUNDC1Q8IVP5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms