Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU68

TMC8, Transmembrane channel-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC8Q8IU68 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC8Q8IU68 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC8Q8IU68 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMC8Q8IU68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMC8Q8IU68 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMC8Q8IU68 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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