Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LDLRAD3Q86YD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LDLRAD3Q86YD5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LDLRAD3Q86YD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms