Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y38

XYLT1, Xylosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XYLT1Q86Y38 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XYLT1Q86Y38 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XYLT1Q86Y38 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XYLT1Q86Y38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms