Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF554Q86TJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF554Q86TJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF554Q86TJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms