Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT9Q86SS6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT9Q86SS6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms