Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5L2

R3HCC1L, Coiled-coil domain-containing protein R3HCC1L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
R3HCC1LQ7Z5L2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1LQ7Z5L2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HCC1LQ7Z5L2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms