Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNA2D4Q7Z3S7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms