Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.059e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.059e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.042e-14■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.029e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.028e-19■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.029e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAP3K11-203ENST00000524856 3787 ntTSL 215.11■□□□□ 0.019e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 02e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-206ENST00000547544 363 ntTSL 314.97□□□□□ -0.019e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-14■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 840 ntTSL 314.82□□□□□ -0.049e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.059e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 414.72□□□□□ -0.059e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.069e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-213ENST00000514589 2443 ntTSL 214.65□□□□□ -0.069e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.079e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-203ENST00000504085 1123 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.089e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-215ENST00000482714 1459 ntTSL 214.5□□□□□ -0.099e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TBRG4-204ENST00000461363 856 ntTSL 214.5□□□□□ -0.099e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.099e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.119e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.129e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-213ENST00000567891 584 ntTSL 314.21□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FANCI-216ENST00000570110 528 ntTSL 314.21□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 DGKQ-202ENST00000502309 818 ntTSL 514.21□□□□□ -0.139e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-218ENST00000567298 4572 ntTSL 514.19□□□□□ -0.149e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.149e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.159e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 214.08□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-214ENST00000551927 531 ntTSL 214.06□□□□□ -0.169e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.168e-7■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.179e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TTC32-203ENST00000431392 779 ntTSL 313.99□□□□□ -0.179e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLXNA1-202ENST00000503234 4446 ntTSL 213.92□□□□□ -0.189e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.199e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPP2R5D-205ENST00000470467 2567 ntTSL 1 (best)13.83□□□□□ -0.25e-11■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 313.81□□□□□ -0.29e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 HBP1-207ENST00000468401 573 ntTSL 413.77□□□□□ -0.219e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.219e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 758 ntTSL 513.76□□□□□ -0.212e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-214ENST00000589745 529 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.229e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-18■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF74-206ENST00000437275 3744 ntTSL 1 (best)13.64□□□□□ -0.239e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 UBE2O-205ENST00000587581 545 ntTSL 413.57□□□□□ -0.249e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.249e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IDH1-204ENST00000417583 702 ntTSL 413.55□□□□□ -0.249e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.249e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAP3K11-204ENST00000526293 571 ntTSL 413.44□□□□□ -0.269e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 MAP3K11-207ENST00000529839 561 ntTSL 413.44□□□□□ -0.269e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.267e-18■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 JAG2-204ENST00000553051 768 ntTSL 313.33□□□□□ -0.289e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.289e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.319e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-212ENST00000564396 563 ntTSL 513□□□□□ -0.339e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 512.97□□□□□ -0.339e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 CCM2-217ENST00000492883 1061 ntTSL 212.96□□□□□ -0.339e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-204ENST00000474374 1161 ntTSL 512.94□□□□□ -0.349e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.369e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.369e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PIBF1-204ENST00000489797 616 ntTSL 312.74□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 OTUD7B-201ENST00000417191 1425 ntTSL 1 (best)12.73□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ASCC3-201ENST00000324696 3618 ntTSL 212.72□□□□□ -0.379e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.389e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.399e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPP2R5D-201ENST00000230402 2958 ntTSL 212.6□□□□□ -0.395e-11■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NLRP1-205ENST00000544378 5281 ntTSL 212.56□□□□□ -0.49e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 IDH1-207ENST00000462386 1614 ntTSL 212.54□□□□□ -0.49e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 412.36□□□□□ -0.439e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.28□□□□□ -0.449e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 PSMD1-202ENST00000373635 3230 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.464e-10■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.479e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.479e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 NEDD8-208ENST00000560427 654 ntTSL 212.07□□□□□ -0.483e-13■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 312.06□□□□□ -0.489e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.489e-6■■■■■ 29.6
LARP4Q71RC2 KLHDC4-214ENST00000565328 582 ntTSL 412.03□□□□□ -0.489e-6■■■■■ 29.6
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