Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYS1Q717R9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYS1Q717R9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYS1Q717R9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYS1Q717R9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms