Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZXV5

TMTC3, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC3Q6ZXV5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMTC3Q6ZXV5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMTC3Q6ZXV5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms