Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZXV5

TMTC3, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC3Q6ZXV5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMTC3Q6ZXV5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMTC3Q6ZXV5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMTC3Q6ZXV5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMTC3Q6ZXV5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMTC3Q6ZXV5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms