Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBR3Q6ZT12 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
UBR3Q6ZT12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
UBR3Q6ZT12 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBR3Q6ZT12 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
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