Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C9orf47Q6ZRZ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C9orf47Q6ZRZ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf47Q6ZRZ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms