Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC129Q6ZRS4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC129Q6ZRS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC129Q6ZRS4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC129Q6ZRS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms