Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CASC2Q6XLA1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CASC2Q6XLA1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms