Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK4Q6UW60 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCSK4Q6UW60 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms