Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNT2Q6UVM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNT2Q6UVM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNT2Q6UVM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms