Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUX4L9Q6RFH8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUX4L9Q6RFH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUX4L9Q6RFH8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms