Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
LARP1Q6PKG0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LARP1Q6PKG0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
LARP1Q6PKG0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
LARP1Q6PKG0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms