Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP4Q6PIL6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP4Q6PIL6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms